Fundada em 1808 e localizada no Terreiro de Jesus, em 1905 foi totalmente destruída por um incêndio e perderam-se inúmeros livros, teses e memórias históricas da Faculdade.

Em 1909 com a colaboração de professores, alunos, médicos e amigos da Medicina, que doaram sua coleções particulares, surge uma nova Biblioteca.

Em 03 de março de 1977, com a inauguração da Faculdade de Medicina, no Vale do Canela, o acervo com aproximadamente 40.000 obras de 1800 até 1969, ficou na antiga Faculdade, no Terreiro de Jesus.

A Biblioteca do Vale do Canela ocupa uma área de 926,07 m2, reúne obras a partir de 1970, com livros, periódicos, teses e fitas de vídeo. E conta com um amplo salão de leitura, videoteca, e ainda:
- Ilha do Portal da CAPES, com 10 computadores disponíveis para o acesso universalizado ao conteúdo de revistas internacionais e de bases de dados referenciais.
- Centro Cooperante da BIREME - Biblioteca Virtual de Saúde que torna disponível aos profissionais desta área, informações técnico-científicas produzidas nacional e internacionalmente.